Op 6 September het soldate die mag oorgeneem, die regering ontbind en Guinee se president Conde aangehou. Kolonel Mamady Doumbouya, 'n voormalige Franse legioenêr, en sy weermag wil 'n oorgangsregering en 'n nuwe grondwet hê. Hy het op TV aangekondig dat alle land- en luggrense gesluit is, die regering is ontbind en 'Guinee vertrou nie meer politiek aan een man toe nie, ons sal dit aan die mense toevertrou.' Conde se gewildheid het gedaal nadat hy die grondwet verander het sodat hy weer kon staan. Dit het tot betogings gelei wat dosyne doodgemaak het. Doumbouya het meer as 80 politieke gevangenes vrygelaat wat 'n veldtog teen die grondwetlike verandering gevoer het en die hoofde van Guinee se verskillende militêre takke ontmoet het om die gewapende magte onder sy bevel te verenig. Wes-Afrika se streeksblok (ECOWAS) het Guinee se lidmaatskap op 7 September opgeskort en op die 9de 'n hoëvlaksending na Guinee gestuur om sy posisie te heroorweeg. ECOWAS is deur aktiviste gekritiseer omdat hulle stilgebly het oor Conde se bod vir die derde termyn.